集菌儀是通過定向蠕動加壓原理，使供試品中微生物截留在濾器中的微孔濾膜0.22µm*47mm或0.45µm*47mm上，通過沖洗濾膜除去抑菌成分，然后把所需的培養(yǎng)基通過進樣管道直接引入全封閉過濾集菌培養(yǎng)器中，放置在培養(yǎng)箱內進行無菌培養(yǎng)。
1、首先取出我們配套使用的一次性培養(yǎng)器先檢查包裝是否完好無損，在無菌室內打開包裝。
2、然后將一次性培養(yǎng)器逐個插放在不銹鋼排液槽上（儀器上的幾個小孔，每個孔安放一個培養(yǎng)皿即可）。
3、將一次性培養(yǎng)器的彈性軟管裝入集菌儀的蠕動泵頭，集菌儀要求定位準確，軟管走勢順暢。
4、打開待檢供試品瓶（袋）的插針孔并做環(huán)形消毒，（若檢測安瓶樣品，先將安瓶頸部做環(huán)形消毒，然后再打開）將樣品瓶（袋）定位。
5、拔去進樣針管護套，針頭和供試品瓶口過酒精燈火焰消毒，插入樣品瓶中，開啟智能集菌儀，將供試品瓶倒置，實施過濾集菌（應避免雙芯針管進氣濾膜被藥液浸濕，影響進氣；若樣品為袋裝不存在該問題）重復操作每個樣品的過濾程序。